開始配戴牙套的前幾天，以及更換新牙套初期，可能出現酸痛感。

墊高會對飲食造成影響，導致無法好好磨碎食物，飲食障礙通常在一至兩週內就會消失。

每天配戴牙套的時間若未達應有的時數或未照醫囑使用本產品，會延長治療週期並影響預期療效。

牙套可能會刮傷牙齦、頰黏膜或嘴唇或使之不適。

治療過程中，可能會在單顆或多顆牙齒上暫時黏上附加物(Attachment)，以利牙套固定或牙齒位移；另附加物可能會脫落，脫落時需重新黏上。

牙套附加物骨釘可能會脫落，脫落時需重新補上。

治療完成時，應一併去除所有附加物。

牙醫師可能採取鄰接面去釉處理以創造牙齒移動所需的空間，應充分考慮此法所伴隨的風險。

若患者在治療過程中未正確刷牙或使用牙線清潔牙齒，或食用含糖食物或飲料前不摘取牙套，可能發生齲齒、牙周病和永久性色素沉澱及脫鈣。

在整個治療過程中，咬合可能會發生變化，可能導致患者出現暫時性不適。

在治療後期，醫師可能需要進行咬合調整。

牙齒可能在治療結束後移位。治療後期持續配戴維持器可降低復發的趨勢。

可能會出現暫時性唾液分泌增加或口乾。

在極少數情況下，顳顎關節(下顎關節)的問題可能會導致關節疼痛、頭痛或者耳部疾患。

每副牙套每日配戴20-22個小時，約2週後必須更換(每副牙套約戴滿300個小時)。

牙醫師可能採取牙齒往後方移動，以創造牙齒移動所需的空間，過程中會暫時性感覺牙縫容易塞食物，覺得不適，要清潔乾淨以避免牙齦發炎。

在治療嚴重開咬，嚴重暴牙，混合齒列及/或顎骨狹窄時，除牙套治療外，可能需要其他輔助治療手段。

對於更加複雜的治療方案，單用牙套可能無法獲得最佳療效，可能會需要應用擴弓裝置、黏接輔助裝置、彈力牽引及其他固定和/或活動式齒列牙套。

若有齒列極度擁擠或顎骨不協調，可能需要進行正顎手術。若需要進行正顎手術，治療前須充分考慮麻醉及癒合的相關風險。

牙套無法移動牙科植體。

特定的醫療狀況和使用特定藥物，可能會影響齒列矯正的療效。